マイクロアレイ解析 Microarray Analysis
10 現在、DNAマイクロアレイを使った網羅的
解析は、遺伝子発現にとどまらず、DNAのコ ピー数変化の網羅的解析(アレイCGH)、複 製・転写調節の研究(ChIP-on-chip、メチレー ション)、選択的転写産物の同定、マイクロ RNAのプロファイリングなど、その応用範囲 が急速に拡大しつつあります。ここでは、ア ジレント社が提供するマイクロアレイのトー タル・ソリューションを紹介します。
次世代高感度マイクロアレイ
アジレント社ではヒューレット・パッカー ド社時代から培ったインクジェットプリンタ 技術を用いて、1 x 3 inchの標準サイズのスラ イドグラス上で60merのオリゴマーをIn situ 合成しています。最新のインクジェット技術 を用いる事により、高感度、高品質、高精度 のアレイをロット差なく提供しています。
マスクレスのため、アレイのフォーマット やコンテンツをフレキシブルに変更する事が できます。現在、1枚のスライドに24万スポッ トまで搭載する事が可能ですが、今年中に 100万スポットを搭載した高密度アレイの販 売を予定しています。アジレントアレイの最 大の特長は、製造技術の改良により、100% 近い合成収率でDNAオリゴマーを合成できる ようになったことです。これにより、従来の マイクロアレイで限界とされていた3 log程度 のダイナミック・レンジの問題を解消し、他 に比類のない5 logのダイナミック・レンジを 達成する事が出来ました。これまで見逃して いた低発現域の遺伝子や転写・調節因子を新 たに検出できるようになり、生命科学に新た な知見をもたらす事が期待されます。
オミクス研究を加速する、幅広い
製品ラインアップ
アジレントでは、研究者の多様なニーズに 答えるために、幅広い製品ラインアップを提 供しています。
【遺伝子発現】
Human, Mouse, Ratの他、多様なモデル生 物について5 logのダイナミック・レンジで網 羅的に発現解析が可能。
【
CGH / CNV
】最適化されたプローブによりノイズ・レベ ルを抑え、微細なコピー数の変化を捉える事 が出来ます。また、臨床サンプルのように、 不均質なサンプルや、FFPEサンプルでも解析 することができます。
【
miRNA
】画期的なプローブ・デザインにより、高い 特異性と感度でmiRNAのプロファイリングを 可能にします。SANGERのmiRBase 10.1
(Human, Mouse, Rat)に対応しています。
【
ChIP-on-chip
】MITのホワイトヘッド研究所が考案した高 精度のChIP-on-chip。Human、Mouse、酵母、 ハエ、その他の生物種で信頼性の高いDNA- Proteinの相互作用(結合)を検出します。
【
DNA
メチレーション】世界で始めて、CpGアイランドのDNAメチ ル化の網羅的解析用アレイを市販化しました。 エピジェネティクス解析を加速させるツール です。
【カスタムアレイ】
目的の生物種がカタログにない、より解像 度高く解析がしたい、一度に多数のサンプル を解析したい。そのようなご希望に答えるた め、アジレントではWebベースのカスタムア レイ・デザイン・ツールeArrayを提供してい ます。デザイン料は無料で、かつ、1スライ ドグラスでもカスタムアレイを製造する事が 可能です。アジレントアレイのフレキシビリ ティを生かしたまさに画期的なツールです。
サンプル QC からデータ解析まで、
すべてをサポート
アジレントでは、アレイだけではなく、ハー ドウェア(バイオアナライザ、ハイブリオー ブン、スキャナなど)、サンプル調製試薬(ラ ベル化試薬、ハイブリ試薬、洗浄バッファ)、 ソフトウェア(数値化ソフト、GeneSpring、 DNA Analytics)などサンプルQCからデータ 解析まで、マイクロアレイの実験に必要なツー ルをトータルで提供しています。また、どの アプリケーションでも同一のハードウェアを 使用することが出来るので、余分な投資をす ることなく複数のアプリケーションを組み合 わせた統合解析が可能になります。
マイクロアレイの実験は始めてという方に もご安心いただけるように、実際のマイクロ アレイを使った各種トレーニングも開催して います。また、マイクロアレイのスペシャリ ストによるサポートも充実しており、お客様 の研究をお手伝いします。
問題点 Problem 解決法 Solution
遺伝子発現アレイ以外のアプリケーションのアレイも 実験したいのですが、新たな設備投資は困難です。
アジレント社が提供するトータル・ソリューションでは、遺伝子発現、 CGH / CNV、miRNA、ChIP-on-chip、DNAメチレーションのアレイを 共通のハードウェアで使用することができます。